相傳村落始創于宋朝末年。
前屬海陽縣隆眼城都。
明成化十三年（1477）屬饒平縣隆眼城都。
1949年10月屬澄海縣隆都區。
1953年福洋、尾頭、鵲巷、盧厝合稱鵲巷鄉。
1956年鵲巷鄉、前埔鄉、前溝鄉、樟籍鄉合稱樟籍鄉，屬四區。
1958年成立澄海縣人民公社，屬第二支隊211團。
1959年設鵲巷生產大隊，屬隆都人民公社。
1984年1月設區建鄉，設鵲巷鄉，屬隆都區。
1986年11月撤區置鎮，設鵲巷村，屬隆都鎮。
1990年9月設鵲巷管理區。
1998年9月設鵲巷村沿用至今。