宋末元初（1271-1294），葉姓先祖從會城來五指尖山東麓建村，初名為葉家村。
明代請塾師黃立忠來此講學，黃立忠于水背娶妻何氏，與何氏生五子后定居此地。
清康熙年間的大型類書《古今圖書集成》已見水背橋、水背村的記載，清康熙縣志記屬瀧水都三圖。
清光緒十九年（1893）建水背新村于舊村西側。
民國時期屬富路鄉。
1951年改屬第七區沙路鄉。
1952-1957年屬第十一區坑背鄉（1955年第十一區改為崖西區）。
1958年屬崖西人民公社坑背管理區。
1959年成立水背大隊。
1984年與坑口合并為坑背鄉。
1986年分出稱水背村委會。
1988年稱水背管理區。
1999年稱水背村委會。
2002年崖南與崖西合并，屬崖門鎮，仍稱水背村委會。