周景王四年（前541），置瀨渚邑。
周景王五年，改名為陵平。
周景王十六年（前529），楚國攻打吳國，占領陵平，更名為平陵，屬楚國。
秦漢時期屬溧陽縣。
三國吳屬永平縣。
西晉太康元年（280），又恢復設立溧陽縣。
隋、唐屬溧水縣。
元屬溧水州。
明朝弘治四年（1491），析溧水縣西南部7鄉置高淳縣，屬應天府。
清屬江寧府。
1914—1927年，屬金陵道。
1934—1937年，屬江寧行政督察區。
1949年屬蘇南行署鎮江專區。
后曾屬江蘇省鎮江專區（地區）、常州專區。
1983年劃屬南京市。
2013年，由高淳縣更名為高淳區，名稱沿用至今。