東晉永和三年（347年），為益昌縣治所，縣址設今聯豐村境內觀斗山。
唐調露年間，朝廷命花衡芝將軍到此平叛。
永淳元年（682年），縣址由安昌東岸（今聯豐村“觀斗山”）遷駐安昌河西岸，益昌縣更名西昌縣，駐江西館，花衡芝即受封為西昌侯。
北宋熙寧五年（1072年），拆縣建鎮，設西昌鎮，屬龍安縣（今安縣）。
1958年，與文星、黃土、界牌、先林等鄉合并為紅旗公社。
1984年11月，文星、先林2公社合并為花荄鎮。
2016年4月，國務院下發《國務院關于同意四川省調整綿陽市部分行政區劃的批復》：同意撤銷安縣，設立綿陽市安州區，以原安縣的行政區域為安州區的行政區域，花荄鎮改屬安州區。
2019年12月，經四川省人民政府同意，撤銷興仁鄉，將其所屬行政區域劃歸花荄鎮管轄。