勐阿原為一土司地。
明隆慶四年（1570年），設12版納時，勐阿、勐海、景真為一版納。
清順治十七年（1660年），為土把總。
民國二年（1913年），隸第二區行政分局（勐遮）。
民國八年（1919年），大勐籠第四區行政分局移于勐往后，改隸之。
1949年，勐阿、勐康為寧江縣轄區，稱安康區。
1953年，成立版納勐阿。
1958年，設勐阿區；同年12月，改為鋼鐵公社。
1959年，復設勐阿區公所。
1968年，改勐阿區革命委員會。
1969年，改為“五四”公社。
1973年，更名勐阿公社。
1984年，復稱勐阿區。
1987年，改勐阿拉祜族鄉。
2003年，改勐阿鎮。